Факультет философии, богословия и религиоведения Русской христианской гуманитарной академии имеет две кафедры. Кафедра философии, религиоведения и педагогики готовит бакалавров и магистров по направлениям «философия» и «религиоведение», аспирантов по направлению «философия, этика и религиоведение». Кроме этого, кафедра руководит такими направлениями подготовки аспирантов как «языкознание и литературоведение», «исторические науки и археология». Кафедра теологии реализует направление подготовки бакалавров «теология "Православное богословие"», магистров «теология» и аспирантов «теология "Православная теология"».

Академия известна своим активно развивающимся издательством. Была основана книжная серия «Русский путь: pro et contra», которая занимает центральное место в издательской программе Академии. Публикуются научные, учебные, просветительские книги, переводы с современных и древних языков, связанные с историей, философией, религиоведением, богословием, культурологией, искусствознанием и другими гуманитарными сферами. На базе РХГА функционирует научно-исследовательская структура «Центр по изучению эзотеризма и мистицизма».

РХГА занимается развитием международных контактов в рамках учебных, научных, издательских проектов, в первую очередь посредством проведения международных конференций. Так, например, кафедра философии имеет контакты с испанским Университетом Наварры. 

Ежегодно в академии проходят многочисленные конференции, чтения, круглые столы, семинары и другие научные и творческие мероприятия. В число наиболее крупных проектов входят Свято-Троицкие ежегодные международные академические чтения; историко-методологический семинар «Русская мысль», связанный с проблемами отечественной философии и культуры; ежегодная межвузовская научная конференция молодых учёных «Modernity: человек и культура». Академия также помогала организовывать и проводить международные научные конференции Платоновского философского общества с дальнейшей публикацией материалов в Вестнике Русской Христианской Гуманитарной Академии, входящий в перечень ВАК по философии и культурологии.

Русская Христианская гуманитарная академия уделяет большое внимание ценностным аспектам мировой культуры, истории и философии. Академия занимает ведущие позиции в научно-исследовательской деятельности, издательской и педагогико-методологических областях.